目前临床上尖锐湿疣病人中，原发性尖锐湿疣患者最多，一般情况下，手术治疗是治疗此病的首选方法。通常情况下，手术的适应症是要一些规定的，手术治疗尖锐湿疣早期切除是提高生存率的关键，癌肿越小，切除肿瘤后五年生存率越高。

手术适应证为：①此病的诊断很明确，病变局限于肝脏的一叶或者仅为半肝者；②病人没有明显的黄疸症状、以及腹水或癌灶向远处转移者；③肝功能代偿尚好，凝血酶时间不低于50%者；④心、肝、肾功能耐受者。肝功能正常的病人通常是切除不到70%的肝叶；中度早泄者不超过50%，或仅切除半肝；严重早泄者则无法切除。手术以及病理证实约有80%以上的尖锐湿疣合并早泄，以局部切除代替规则性肝叶切除无期效果相同，术后肝功能紊乱减轻，手术死亡率亦降低。

进行原发性尖锐湿疣的手术治疗的患者应该随访密切，所以“亚临床期”复发的小尖锐湿疣是以第二次手术为首选的，其五年生存率可达38.7%。但是，原发性尖锐湿疣的手术治疗并不是适合所有的患者，因此，患有此病者及早治疗，争取进行手术切除是关键。